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当“看见细胞”走向“预测细胞”:多色成像如何为AI虚拟细胞注入真实数据

光学多重成像是生命科学与生物医学的核心工具,可同时可视化多种蛋白、细胞器或生物分子。活细胞多重成像长期受限于荧光染料的宽发射光谱,传统荧光显微镜通常难以同时清晰区分超过4-5种颜色。
当下火热的虚拟细胞模型构建,同样高度依赖活细胞内动态的实测成像数据作为训练基础。相比之下,拉曼散射峰宽极窄,尤其在细胞静默区(1800-2800 cm⁻¹)几乎没有内源分子干扰,是实现超高多重成像的优质技术通道。
前沿突破:活细胞多结构同步精准观测
2018 年,哥伦比亚大学闵玮团队在Nature Methods上发表了题为Supermultiplexed optical imaging and barcoding with engineered polyynes的研究,开发了工程化多炔拉曼探针“Carbow(碳彩虹工程化多炔拉曼探针)”。该团队通过调控多炔链长和同位素标记,获得了一系列拉曼位移可调、峰窄且信号强的探针,并成功用于活细胞超多重光学成像与条形码编码,突破了传统标记技术的维度限制。

在活细胞细胞器多重染色部分,该团队使用多种端基功能化的Carbow分别靶向线粒体(Mito)、溶酶体(Lyso)、质膜(PM)、内质网(ER)和脂滴(LD),同时结合靶向高尔基体(Golgi)、细胞核(Nuc)等的荧光探针,实现了“拉曼+荧光”在活细胞器动态研究中的巨大应用潜力。

图1:Carbow拉曼探针可实现亚微摩尔级别的检测信号响应,并具备良好的振动选择性和多通道联合成像特性。
平台实证:振电科技多模态系统复刻前沿成像成果
振电科技UltraView多模态非线性光学显微成像系统融合相干拉曼与荧光成像技术,支持单次实验实现活细胞多靶点同步成像。借助拉曼静默区染料探针窄峰标记,复现了4种Carbow拉曼探针的细胞器标记,并与两种荧光探针联用,在活细胞中实现了多重染色,进一步验证了该策略在细胞生物学研究中的可行性。

图2:四种Carbow拉曼探针(质膜PM、线粒体Mito、内质网ER、溶酶体Lyso)与相应荧光染料对活细胞呈现良好的共定位效果,可精准靶向相应细胞器。
相干拉曼通道(SRS):采用功能化的Carbow探针分别标记质膜(PM)、线粒体(Mito)、内质网(ER)与溶酶体(Lyso)。探针自带特征炔基化学键,在细胞拉曼静默区产生极窄的特征拉曼峰,各探针之间几乎无光谱串扰,并且光谱与荧光通道完全正交。
双光子通道(TPEF):选用BODIPY TR-ceramide靶向高尔基体(Golgi)、Tubulin Tracker 标记活细胞微管骨架网络。两种荧光探针在近红外飞秒激光下进行双光子激发,其荧光发射位于可见光区;而SRS检测的是近红外pump差分信号。二者可有效分离,实现TPEF与SRS的多通道复合成像。

图3:细胞(HeLa )多色多模态成像。
通过振电科技UltraView多模态成像平台,结合细胞静默区工程化拉曼染料、光谱拆分算法与TPEF荧光双通道,实现细胞多色同步成像。在单次活细胞实验中完成六种亚细胞结构的同步、长时间、低损伤观测。

图4:细胞(U2OS)多色多模态成像。
通过振电科技UltraView多模态成像平台,使4种Carbow拉曼细胞器探针联合2种荧光探针,对活细胞实现多色成像。各细胞器轮廓完整清晰,不同通道信号分离度良好。
UltraView多模态成像协同赋能超多重活细胞成像
振电科技UltraView多模态非线性光学显微成像系统,通过拉曼染料极窄的光谱峰宽,系统理论上支持多达30色标记潜力,并支持多种功能探针混合共孵育,单次成像完成多靶点信号同步采集。
高灵敏度与特异性成像
结合相干拉曼成像技术,探针拥有优异的检测灵敏度与光谱特异性,在同一套系统上完成细胞器、特定靶标蛋白的特异性成像,实现多类标记体系兼容。
超多重活细胞成像能力
依托多模态成像,可实现多色活细胞同步成像,搭配多模态低损伤成像方案,可对活细胞开展长时间动态追踪观测,降低光毒性、光漂白对活细胞样本的干扰。
良好的活细胞兼容性
探针光稳定性优异、细胞毒性低,同时具备良好细胞膜通透性,可满足活细胞长时间动态观察的实验需求。
广泛的科研适用场景
可应用于发育生物学、神经系统研究、肿瘤微环境解析、原位RNA分析等多个前沿生命科学方向。
近期随着虚拟细胞的火热,模型的仿真精度需要依托真实成像数据的支撑。振电科技UltraView多模态成像平台不止实现了高精度多维度活细胞成像,也为虚拟细胞研究提供了可复用、高保真的活细胞原位动态数据资源。
振电科技打通了前沿探针技术与科研落地的应用壁垒,依托相干拉曼与双光子荧光同步采集能力,突破传统荧光成像局限,在保真细胞生理状态下完成多靶点并行观测,既为细胞生物学动态研究提供高效成像方案,也为生命科学从“看见细胞”向“预测细胞”的范式升级,夯实了核心数据基础。
文献来源:
[1] Hu F, Zeng C, Long R, et al. Supermultiplexed optical imaging and barcoding with engineered polyynes[J]. Nature Methods, 2018, 15(3): 194-200. DOI: 10.1038/nmeth.4578.
[2] Wei L, Chen Z, Shi L, et al. Super-multiplex vibrational imaging[J]. Nature, 2017, 544(7651): 465-470. DOI: 10.1038/nature22051.