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2026-09-18

一文搞定相干拉曼生物样本制样:制备关键要点与标准化实操全流程

振电科技-国产科研仪器设备厂商

相干拉曼散射成像凭借无标记、高特异性、高空间分辨率、多模态兼容的技术优势,适用于植物学、组织病理、类器官发育、细胞微观表征、微生物检测等生命科学研究领域。

区别于传统荧光成像,相干拉曼成像依托分子固有振动光谱实现成像,对样本制备的洁净度、结构完整性、背景干扰控制要求较高。不规范的制样流程易引入C–H基团背景信号、破坏样本原生结构,直接影响成像分辨率与数据准确性。

本文基于振电科技标准化生物样本制样方案,系统梳理适配相干拉曼成像的通用制样原则,以及动物组织、模式生物、类器官、细胞、微生物的标准化取材、固定、处理、切片及保存流程,为各类相干拉曼成像实验提供合规、可复用的技术参考。

一、相干拉曼成像通用制样原则

为保障相干拉曼的成像质量,所有生物样本制样需严格遵循两大核心原则,从源头规避成像干扰、保留样本真实理化特征。

  1. 避免检测窗口的化学背景干扰

    固定液和包埋剂中的C–H基团可能产生明显背景信号,成像前应充分漂洗,尽可能去除OCT、PFA等残留。石蜡包埋切片原则上不用于相干拉曼成像,其中含有大量C–H键,可能产生持续而强烈的背景。脱蜡不充分还可能残留石蜡,同时有机溶剂处理可能改变样本组分。因此,组织切片优先采用冷冻切片。

  2. 尽量维持样本的含水状态

    SRS/CARS成像建议在水相环境中进行,最大程度维持细胞和组织的原生结构。封片剂可能引入额外光谱背景。本方案原则上客户按对应流程提供样本即可,制样由我司提供(特殊情况除外)。

二、各类生物样本标准化制样规范

1.冷冻切片通用要求

冷冻切片适用于快速制样、需保留组织抗原性与原生分子结构的相干拉曼成像实验。对于SRS/CARS,切片平整度尤为重要。褶皱、厚度不均等情况可能导致局部非共振背景波动并影响图像质量。

  • 切片厚度建议<50 μm:常规建议20–30 μm。若目标为单层细胞,厚度应根据细胞大小确定,通常≤20 μm。

  • 背向2PL或SHG:推荐切片厚度50–100 μm。

  • 多模态成像SRS + 2PL/SHG:则要兼顾透射和背向,切片厚度视样本情况而定。

  • 成像前应使用PBS充分漂洗,以尽可能去除OCT、PFA等残留,降低C–H基团引起的背景干扰。

  • 人或小鼠脑组织如需进行深度3D成像,可考虑透明化处理:新鲜或固定脑组织→50% urea(w/v)+1%β-CD1(hydroxyethyl-β-cyclodextrin),溶剂为d6-DMSO→ 60 °C 孵育5–10 min(约1 mm样本)或60 °C孵育40 min(约2 mm样本)→完成后将组织置于同种透明化溶液中进行SRS成像[1]

2.模式动物样本

2.1果蝇

麻醉/处死并解剖目标组织→4%PFA室温水平摇床固定15 min→PBS清洗3次,每次10 min→10%蔗糖过夜→OCT包埋并快速冷冻→冷冻切片→防脱载玻片→ SRS/CARS成像[2]

2.2线虫

整体固定→4%PFA固定→PBS清洗;必要时进行轻度透化→SRS/CARS成像[3]。线虫体壁较薄,整体样本可用于相干拉曼成像。

2.3斑马鱼

  • 胚胎:整体固定→4%PFA固定→PBS清洗;必要时进行轻度透化→SRS/CARS成像 [4]。斑马鱼胚胎卵黄富含脂质,可用于脂质相关研究。

  • 幼鱼(<5 hpf):可进行整体或切片成像。20‑24 hpf开始出现色素形成;可在培养阶段加入PTU抑制色素生成,也可在固定后采用H₂O₂+KOH去除色素干扰。

整体成像:麻醉/处死→4%PFA固定→PBS清洗→SRS/CARS成像。

切片成像:麻醉/处死→4%PFA固定→PBS清洗→蔗糖处理→OCT包埋并快速冷冻→冷冻切片→防脱载玻片→SRS/CARS成像[5,6]

  • 成鱼:麻醉/处死并解剖目标组织→4%PFA固定→PBS清洗→蔗糖处理→OCT包埋并快速冷冻→冷冻切片→防脱载玻片→SRS/CARS成像[7]

2.4 小鼠(以脑组织为例)

PBS灌流→4%PFA灌流→取脑→4%PFA,4 °C固定→PBS清洗→10%蔗糖→20%蔗糖→ 30%蔗糖→OCT包埋→快速冷冻(液氮、异戊烷、干冰或部分Cryostat自带快速冷冻功能)→冷冻切片→防脱载玻片→SRS/CARS成像[8,9]

固定时间参考:小块肝、肾、肿瘤组织约4–12h;心脏、肺等较厚组织约8–24h;脑组织灌流后通常再固定数小时至过夜;脊髓可固定数小时至过夜。固定温度通常为4 °C;固定液体积建议至少为组织体积的10–20倍。

切片制样:用约0.1mm厚双面胶围绕载玻片上的切片形成矩形腔室,加入PBS/无菌水后覆盖盖玻片并轻压,制成双盖玻片夹心样本,避免产生气泡。

3.类器官

3.1 固定类器官球体

类器官培养→去除基质胶→4%PFA固定→PBS轻柔清洗3次→ 4°C低温运输[10]

  • 固定时间参考:直径<500 μm,4 °C固定2–4h;直径>500 μm,4 °C固定6–12h或过夜。

  • 基质胶去除:以Dispase为例,使用基础培养基将Dispase配制为1mg/mL,37 °C预热;加入1mL/孔工作液,37 °C孵育30 min,期间可轻柔吹打辅助消化;用含血清培养基终止消化后PBS清洗3次。操作过程中应避免吹散或破坏类器官球体。

  • 可选透明化:对于结构致密或直径>500 μm的类器官,如有效成像深度受限,可考虑透明化处理。

3.2 活体类器官球状

类器官置于适宜培养的体系中常温运输,尽快完成SRS/CARS成像。

3.3 类器官冷冻切片

固定后的类器官球体→30%蔗糖(必要时)→OCT包埋并快速冷冻→冷冻切片→防脱载玻片→SRS/CARS成像[11]

  • 球体制样:在盖玻片上用约0.1 mm厚双面胶围出与球体高度相当的腔室,加入PBS后覆盖另一盖玻片并轻压,避免气泡。

  • 切片制样:在载玻片上用约0.1 mm厚双面胶围出矩形腔室,加入PBS/无菌水后覆盖盖玻片并轻压,避免气泡。

上述切片样本可置于切片盒内,保存及运输,保存及运输盒如下图:

保存及运输盒

4. 细胞样本

4.1 悬浮细胞

悬浮细胞800–1000 rpm/min,室温离心3–5 min,去除培养基→PBS重悬清洗→800–1000 rpm/min,室温离心3–5 min→弃上清→4%PFA重悬,室温固定10–15 min→室温离心3–5 min→弃上清→PBS重悬并清洗2–3次→4 °C保存或低温运输→SRS/CARS成像[12]

细胞密度建议>1×10^6/mL;若细胞量有限,可采用较小体积PBS重悬,但建议最终体积>50μL。

  • 制样:将约0.1 mm厚双面胶贴于盖玻片上,取1.5 μL样本滴加于腔室内,室温静置3–5 min,再覆盖另一盖玻片并轻压,形成双盖玻片夹心样本。

4.2 贴壁细胞

细胞培养于共聚焦皿或细胞爬片(约0.17 mm厚,直径14–20 mm)→去除培养基→PBS清洗2–3次→4%PFA,室温固定10–15 min→PBS清洗2–3次→4 °C保存或低温运输→SRS/CARS成像[13]。细胞汇合度建议60%–80%,特殊实验目的除外。

  • 制样:共聚焦皿可直接用于成像;如需更高分辨率,建议使用细胞爬片。爬片可倒扣于载玻片上的 PBS 中,避免气泡,并使用UV胶固定边缘。

5. 细菌/真菌

根据样本特性采用约10,000×g离心5–10 min,去除培养基→1 mL4%PFA/组织固定液重悬,室温固定10–15 min→约10,000×g离心5–10 min→弃上清→PBS清洗2–3次→4 °C保存或低温运输→SRS/CARS成像[14]

细胞/菌体密度建议>1×10^7/mL;若样本量有限,可采用较小体积PBS重悬,但建议最终体积>50 μL。

  • 制样:将约0.1 mm厚双面胶贴于盖玻片上,取1.5 μL样本滴加于腔室内,室温静置3–5 min,再覆盖另一盖玻片并轻压,形成双盖玻片夹心样本。

三、样本运输与保存

样本运输与保存


参考文献

  1. Liu Z, Li Y, Chen L, Wei M, Wei M, Sun Y, et al. Ultrarapid deep 3D histology with cleared stimulated Raman imaging and AI. Cell. 2026. [Early/online publication information should be updated according to the final journal record].

  2. Watson J, Roth JR, Melkani GC. Direct Cryosectioning of Drosophila Heads for Enhanced Brain Fluorescence Staining and Immunostaining. J Vis Exp. 2025;(216):e67791. doi:10.3791/67791.

  3. WormBook: The Online Review ofC. elegans Biology

  4. Thisse C, Thisse B. High-resolution in situ hybridization to whole-mount zebrafish embryos. Nat Protoc. 2008;3(1):59-69. doi:10.1038/nprot.2007.514.

  5. White RM, Sessa A, Burke C, Bowman T, LeBlanc J, Ceol C, et al. Transparent adult zebrafish as a tool for in vivo transplantation analysis. Cell Stem Cell. 2008;2(2):183-189. doi:10.1016/j.stem.2007.11.002.

  6. Karlsson J, von Hofsten J, Olsson PE. Generating transparent zebrafish: a refined method to improve detection of gene expression during embryonic development. Mar Biotechnol (NY). 2001;3(6):522-527. doi:10.1007/s1012601-0053-4.

  7. Spitsbergen JM, Kent ML. The state of the art of the zebrafish model for toxicology and toxicologic pathology research—advantages and current limitations. Toxicol Pathol. 2003;31(Suppl):62-87. doi:10.1080/01926230390174959.

  8. Ohno Y, Murphy R, Choi M, Ou W, Sumbria RK. Full- versus Sub-Regional Quantification of Amyloid-Beta Load on Mouse Brain Sections. J Vis Exp. 2022;(183):e63669. doi:10.3791/63669.

  9. Kang J, Watanabe H, Shen J. Protocols for assessing neurodegenerative phenotypes in Alzheimer's mouse models. STAR Protoc. 2021;2(3):100654. doi:10.1016/j.xpro.2021.100654.

  10. Luongo R, Walsh RM, Verrillo A, Studer L, Baggiolini A. Protocol for generating human cortical organoids enriched in outer radial glia by guided differentiation. STAR Protoc. 2024;5(3):103280. doi:10.1016/j.xpro.2024.103280.

  11. Xian L, Chia L, Georgess D, Luo L, Shuai S, Ewald AJ, Resar LMS. Genetic Engineering of Primary Mouse Intestinal Organoids Using Magnetic Nanoparticle Transduction Viral Vectors for Frozen Sectioning. J Vis Exp. 2019;(147):e57040. doi:10.3791/57040.

  12. D’Antonio-Chronowska A, D’Antonio M, Frazer KA. In vitro Differentiation of Human iPSC-derived Retinal Pigment Epithelium Cells (iPSC-RPE). Bio Protoc. 2019;9(24):e3469. doi:10.21769/BioProtoc.3469.

  13. Asano SM, Gao R, Wassie AT, et al. Expansion Microscopy: Protocols for Imaging Proteins and RNA in Cells and Tissues. Curr Protoc Cell Biol. 2018;80(1):e56. doi:10.1002/cpcb.56.

  14. iGEM Nantes. Microbiology/organism fixation protocols. 2019. Available from: https://static.igem.org/mediawiki/2019/1/11/T--Nantes--allprotocols.pdf. [Protocol/manual rather than peer-reviewed journal article].

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